bioinfo & microbiome

  • 홈
  • 태그

[논문리뷰] 1

Snowflake - 마이크로바이옴 데이터 시각화

* Motivation 마이크로바이옴 데이터는 기본적으로 상당히 많은 ASVs 를 포함하고 있기 때문에 해당 ASVs 들의 상대적 풍부도를 나타내고 샘플 간의 비교를 위한 시각화를 하는데에 많은 고민이 필요합니다.  다만, 현재는 아래와 같은 막대그래프를 기반으로 하는 시각화 방법이 어느 정도 정착하여 가장 많이 사용되고 있으며 시각적으로 각 feature 의 상대적 풍부도나 샘플 간의 비교를 꽤나 직관적으로 할 수 있게 해 줍니다.   그럼에도 위와 같은 시각화도 완벽하지는 않습니다. 일반적으로 누적막대차트 형태이기 때문에, minor taxon 이라 불리는 전체 샘플 중 정말 작은 부분만을 차지하는 ASVs 에 대해서는 시각적으로 제대로 전달하지 못하게 되며 이는 대다수의 minor ..

[논문리뷰] 2024.04.30
이전
1
다음
더보기
프로필사진

  • 분류 전체보기 (67)
    • bioinfo (29)
    • [RNA-seq] (4)
    • 기타 (24)
    • [머신러닝] (9)
    • [논문리뷰] (1)
    • 피부 마이크로바이옴 (0)

Tag

intestinal permeability, illumina Miseq, 차원축소, DNBSEQ, 회귀, PCR, sequencing quality, 영화, MGI, LPs, qiime2, 우분투, 머신러닝, 빅데이터분석기사, Illumina, phred quallity score,

최근글과 인기글

  • 최근글
  • 인기글

최근댓글

공지사항

페이스북 트위터 플러그인

  • Facebook
  • Twitter

Archives

Calendar

«   2025/06   »
일 월 화 수 목 금 토
1 2 3 4 5 6 7
8 9 10 11 12 13 14
15 16 17 18 19 20 21
22 23 24 25 26 27 28
29 30

방문자수Total

  • Today :
  • Yesterday :

Copyright © Kakao Corp. All rights reserved.

티스토리툴바