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Illumina 1

Sequencing quality (Illumina Miseq) : 1

오늘은 실제 NGS 데이터의 QC를 수행하면서, 궁금했던 부분에 대해 공부한 것을 작성하기 위해 포스팅합니다. Sequencing quality (Phred quality score) : 1 (microbiome) 시퀀싱이 완료된 후 파일을 전달받아서 demux 를 하면 해당 sequencing run 에서의 seqeuncing quality 를 확인할 수 있습니다. 퀄리티를 확인한 뒤 quality control tools 를 사용해서 300 bp 의 foward, reverse read 의 hiimgood.tistory.com 제가 실제 NGS 를 수행한 데이터는 아니지만, 일반적으로 위와 유사한 특징을 같고 있습니다. 그래서 일반적으로 보이는 특징 중에서, 궁금했던 것들에 대해 작성해 보겠습니다. ..

bioinfo 2023.09.01
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phred quallity score, 영화, 회귀, illumina Miseq, 빅데이터분석기사, PCR, 머신러닝, DNBSEQ, sequencing quality, LPs, intestinal permeability, 우분투, qiime2, 차원축소, Illumina, MGI,

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