시퀀싱이 완료된 후 파일을 전달받아서 demux 를 하면 해당 sequencing run 에서의 seqeuncing quality 를 확인할 수 있습니다. 퀄리티를 확인한 뒤 quality control tools 를 사용해서 300 bp 의 foward, reverse read 의 어느 정도를 자르고, 어느 정도를 가지고 분석할것인지를 선택할 수 있습니다. (저의 경우에는 qiime2 에서 DADA2 를 사용합니다.) 이 과정에서 quanlity score 에 대한 것은 illumina 홈페이지에서 확인할 수 있습니다. sequencing quality score 란, 각각의 염기가 잘못 호출될 가능성을 나타내는 지표로 각각의 염기에 대해 phred-like algorithm 을 사용하여 가능성을 측정..
