Intestinal Permeability : 3 (Intestinal permeability related proteins)

지난번 포스팅을 통해 intestinal permeability를 측정할 수 있는 방법을에 대해 알아보았습니다. 

 

저도 관련 실험을 한번 해보고 싶어서 일단 가장 많이 사용되는 TEER (Transepithelial Electrical Resistance) 측정을 하면 좋을 것 같다고 생각을 했고 실제로 기기만 보유하고 있으면 상당히 간단하게 측정이 가능하다고 합니다. 문제는 해당 기기를 보유하고 있는 연구실이 있는지와, 있다고 해도 우리가 사용할 수 있을지가 확실하지 않아서 만약 TEER 측정이 불가하다면 차선책으로 어떤 것이 좋을까에 대해 생각해 보게 되었습니다.

 

그러던 중  intestinal permeability 와 관련된 단백질의 mRNA 발현양을 측정하여 비교하는 방법을 아래 논문에서 보게 되었습니다.

 

Salmonella Phages Affect the Intestinal Barrier in Chicks by Altering the Composition of Early Intestinal Flora: Association Wit

 

해당 논문에서는 intestinal permeablity 와 관련된 단백질 중 'tight junction' 의 발현과 관련된 mRNA 유전자인 

1. claudin-1

2. occludin

3. ZO-1

의 발현양을 RT-qPCR 을 사용하여 측정한 뒤 그것을 intestinal permeability 의 증가 또는 감소의 근거로 들고 있습니다.

 

 

해서, 이런 것들은 그래도 해볼만하지 않나 하는 생각이 들었고 이런 타깃 유전자들을 조금 더 찾아놓으면 나중에 도움이 될 것 같다고 생각했습니다.

 

1. RNA 추출

2. 역전사 수행해서 gDNA 합성

3. 특정 유전자 타겟하는 프라이머 사용해서 RT-qPCR 수행

 

 

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# intestinal permeability related proteins (genes) - chatGPT

(chatgpt 로 찾아보고 틀린 정보가 있을 수 있기에 한번 더 확인해 본 뒤 확실히 해볼 만한 것들만 빨간색으로 마킹했습니다.)

 

Tight Junction Proteins

1. Zonula Occludens-1 (ZO-1)
2. Claudin-1
3. Occludin

Adherens Junction Proteins

1. E-cadherin : 암의 진행정도와 관련된 종양표지자

Mucins

1. MUC2

Inflammatory Markers

(직접적인 관련이 있는 것들은 아니지만 논문들에서 항상 같이 보는 것들이라 넣어봤습니다.)

1. Tumor Necrosis Factor-Alpha (TNF-a)
2. Interleukin-1 Beta (IL-1B)
3. Interleukin-6 (IL-6)

Toll-like Receptors (TLRs)

1. TLR2 and TLR4 :장 상피의 기능적인 장벽 무결성을 유지하기 위한 메커니즘에 관여

Zonulin

1. Zonulin : 세포 간 tight junction 에 대한 생리학적 조절인자

Intestinal Transporters

1. Solute Carrier Family Members (SLC5A1 or SLC26A3) : 물질 수송 관련

 

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틀린 부분에 대한 수정의견 많이 부탁드립니다.

 

 

 

 

 

 

# reference

 

1) Zhao, Hongze, et al. "Salmonella phages affect the intestinal barrier in chicks by altering the composition of early intestinal flora: association with time of phage use." Frontiers in Microbiology 13 (2022): 947640.

 

2) Cario, E. "Barrier-protective function of intestinal epithelial Toll-like receptor 2." Mucosal immunology 1.1 (2008): S62-S66.

 

3) Uronen‐Hansson, Heli, et al. "Toll‐like receptor 2 (TLR2) and TLR4 are present inside human dendritic cells, associated with microtubules and the Golgi apparatus but are not detectable on the cell surface: integrity of microtubules is required for interleukin‐12 production in response to internalized bacteria." Immunology 111.2 (2004): 173-178.